上科大以理工科為主，設立物質科學與技術學院、生命科學與技術學院、信息科學與技術學院和創業與管理學院等四個學院，實行大學院制，學院下不設系。學校設立免疫化學研究所和iHuman研究所等兩個研究所。VRg校園資訊網

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上科大按照1:10–1:12的師生比建設一支1000人規模的專任教師隊伍，規劃選聘500位常任教授和500位特聘教授。其中，常任教授主要來源于國際著名大學的知名學者和優秀青年學者，實行常任教授制（TenureSystem）；特聘教授主要來源于中科院上海分院研究院所的優秀科學家以及國內外著名教授。截至2016年5月，學校已選聘394位專任教師（107位常任教授，287位特聘教授），其中包括3位諾貝爾獎獲得者、6位美國國家科學院院士、2位英國皇家學會會士、26位中國科學院院士、3位中國工程院院士、95位國家杰出青年科學基金獲得者以及72位國家/外專/青年/上海“千人計劃”人才。VRg校園資訊網

上科大培養本科生、碩士研究生、博士研究生以及專業學位研究生，在校學生規模規劃為本科生2000名，研究生4000名。2013年學校招收了首屆296名中科院聯培研究生。學校面向全國9省市招收了首屆207名本科生。截至2015年底，學校共有本科生（兩屆）共504人，研究生（三屆）共1055人。VRg校園資訊網

上科大秉持“立志、成才、報國、裕民”的育人理念，致力于培養德才兼備，從事科學發現、高技術創新與新興產業創業的拔尖人才，成為未來的科學引領者、技術發明者和企業創辦者。學校實行書院制，學院、書院分工協作培養人才，其中學院側重于專業能力的培養，書院側重于綜合素質培養和人格養成。學校實行本科生導師制，為每位本科生配備導師，在學業、生活、職業等多方面為學生提供全方位的指導。學校注重社會創新實踐、科研創新實踐及產業創新實踐，2015年開展了首次本科生暑期社會實踐活動，實踐地點遍布全國8省/自治區。學校致力于構建國際化的學習環境，為優秀學生提供充足的海外學習交流機會。VRg校園資訊網

上科大瞄準物質科學與技術、生命科學與技術和信息科學與技術的前沿領域同時開展教授個體科研和圍繞重大目標的團隊科研，推動學科交叉融合、大學與國家級科研機構融合，構建科技進步驅動產業發展的完整創新價值鏈，針對國家在轉型發展過程中所面臨的一系列嚴峻挑戰，探索基于科技創新的解決方案。目前，物質、信息、生命、創管學院以及免疫化學研究所、iHuman研究所已制定了學科/平臺建設規劃，常任教授、科研人員正陸續到位，截至2016年4月已建立95個研究組，科研工作全面開展，高水平科研成果開始涌現。作為張江綜合性國家科學中心的核心依托單位，學校將與中科院上海分院等單位合作建設活細胞成像、超強超短激光、自由電子激光等一系列大科學裝置，實施一系列重大科學研究項目，為上海加快建設具有全球影響力的科技創新中心做出重要貢獻。VRg校園資訊網